Le FC Flora Tallinn est un club de football estonien évoluant en Meistriliiga et basé à Tallinn.
Quinze titres de champion d'Estonie, huit Coupes d'Estonie, onze Supercoupes d'Estonie et une Coupe de Livonie composent notamment le palmarès d'un des clubs les plus titrés et les plus populaires du football estonien.
Le Flora est le club le plus populaire d'Estonie. Le Flora est, avec le Levadia l'un des principaux pourvoyeur d'internationaux estonien.
L'équipe possède deux équipes réserves le FC Flora II Tallinn (deuxième division) et le FC Flora III Tallinn (quatrième division).